Kagura Rentaro atau lebih dikenal Kamen Rider Shinobi, setelah berlatih cukup berat dari shinobi legendaris Hanzo, kini ia kembali ke Asakusa bersama dengan Asuka, dan akan membantunya menjadi ninja sampai hari kelulusan nanti. Selain itu dia dan Hattari akan sibuk melawan Yoma.

Setelah mengalahkan Another Decade, Tokiwa Sougo melakukan reset dan pemisahan dunia dengan mengorbankan kekuatan Ohma Zi-O miliknya, dan dengan sisa kekuatan yang ada, kini ia memutuskan untuk menjadi pengawas dan pelindung multiverse bersama teman-temannya.

Setelah terkena dampak pemisahan dunia oleh Tokiwa Sougo, Emu dan kawan-kawan memutuskan untuk tetap tinggal didunia baru mereka, dan membantu para dewi didunia baru tersebut.

Setelah pertarungan Kiryu Sento dan Banjou Ryuga bersama Heisei Rider melawan Super Time Jacker Tid, Sento dan Banjou memutuskan melanjutkan perjalanan mereka. Namun akibat time reset dan pemisahan dunia yang di lakukan oleh Tokiwa Sougo, kini mereka berdua terjebak di dunia tanpa Kamen Rider.

Oke, mari kita lakukan ini untuk yang pertama kalinya, ya? Sungguh-sungguh kali ini, ini dia. Namaku Peter Parker. Aku digigit laba-laba radioaktif. Dan selama 2 bulan, aku telah menjadi sosok yang dikenal Spider-Man. Dan kupikir kalian tahu sisanya, ya aku menyelamatkan banyak orang, tertabrak drone dan bersama Itsuka Shidou berhadapan dengan sosok yang di kenal sebagai Spirits.

Ben Reilly atau lebih dikenal Scarlet spider , sedang terdampar ke dunia para Spirits wanita! apakah ia mampu menolong Shidou untuk menyegel kekuatan para Spirits tersebut?